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脂肪的最小单位是脂肪酸。甲状腺激素能促进游离脂肪酸的利用，加速脂肪的分解，对生长激素、肾上腺素的溶脂功能起调节作用。甲亢时胆固醇降低，甲减时胆固醇升高。
甲亢时，脂肪动员、利用和消耗均加速。患者迅速消瘦，血液中的胆固醇会稍低于正常。而甲减时则相反，脂肪动员、利用和消耗均减慢。患者体重增加，甚至出现黏液性水肿，胆固醇升高。但无论是甲亢还是甲减，血液中的游离胆固醇和总胆固醇的比率均都在正常范围。
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